Un poco de teoria: runlevel.

Os cuento un poco de teoria que me ha venido muy bien. En linux existen varios niveles de ejecucion (modos de iniciar el sistema). Estos son:

Runlevel 0: Apagar la máquina.
Runlevel 1: Modo Monousuario como usuario root.
Runlevel 2: Modo Multiusuario sin soporte de red.
Runlevel 3: Modo Multiusuario con soporte de red.
Runlevel 4: Modo Multiusuario con soporte de red.
Runlevel 5: Modo Multiusuario con el servidor gráfico y soporte de red.
Runlevel 6: Reiniciar la máquina.

Para saber en que nivel iniciamos nosotros nos basta con utilizar el comando runlevel.
Todo esto viene a que necesitas saber tu nivel para poder indicar que quieres ejecutar un script en el arranque del sistema. Una vez que sabemos el nuestro nivel de ejecucion, entonces vamos al directorio /etc/rc2.d (el mio es el 2). En este directorio estan los enlaces simbolicos al script y ya de paso para quedar mejor que mejor podemos direccionar la salida de error a /var/log